Les Lyonnais s'apprêtaient à effectuer une remise en jeu à la 44e minute lorsque l'arbitre a porté une main à sa tête après avoir été frappé par ce qui semblait être une pièce de monnaie.
L'équipe médicale de Lyon a soigné l'arbitre assistant avant que les joueurs et les officiels ne quittent le terrain.
Le match a été interrompu pendant environ 40 minutes.
"Sur la base des informations fournies par le club et en collaboration avec les autorités, l'individu a été interpellé à la sortie du stade et se trouve actuellement en garde à vue", a déclaré le club hôte de Saint-Étienne dans un communiqué.
"Saint-Etienne déposera demain une plainte formelle à son encontre. Le club agira également avec la plus grande sévérité en imposant ses propres sanctions les plus strictes afin que cet acte isolé ne reste pas impuni."