Bagnaia a réalisé un brillant dernier tour sur le circuit international de Sepang pour décrocher sa première pole depuis le Grand Prix de Catalogne en septembre et battre le poleman de l'an dernier, Jorge Martin, qui a chuté dans les dernières minutes de la Q2 dans le quatrième virage.
L'Italien de 26 ans, en quête de sa deuxième couronne mondiale, sera rejoint par le pilote Pramac et Enea Bastianini sur la première ligne dimanche, alors qu'il cherche à creuser l'écart avec son rival au titre qui compte 13 points de retard au classement.
Alex Marquez partira en quatrième position après avoir montré un rythme prometteur lors des qualifications.