Le joueur de 31 ans, qui était prêté à Utrecht depuis le début de l'année, met fin à une période en dents de scie avec Dortmund, après s'être remis d'un cancer et être revenu sur le terrain.
Un cancer des testicules lui a été diagnostiqué peu après son arrivée au club en juillet 2022. L'attaquant a subi deux opérations et une chimiothérapie dans les mois qui ont suivi avant de revenir jouer début 2023.
Il a disputé un total de 33 matches de Bundesliga et marqué neuf buts.
"Sébastien a écrit une histoire particulière ici. Il a combattu son cancer avec une force impressionnante", a déclaré Sebastian Kehl, directeur sportif de Dortmund.
"Aujourd'hui, il revient à Utrecht, dans un club qui compte beaucoup pour lui et pour lequel il a régulièrement joué ces derniers mois. Nous souhaitons à Sébastien tout le meilleur pour l'avenir et, surtout, une bonne santé."
Haller a joué pour Utrecht au début de sa carrière, de 2015 à 2017.