Le Nord-Irlandais de 35 ans, quatre fois vainqueur d'un Majeur, a réalisé trois birdies et un eagle sur le retour pour signer une carte de 66, soit six coups sous le par, et terminer à -21 au total sur le célèbre parcours californien au bord de l'océan Pacifique.
"Certains diront que les parcours sur lesquels j'ai gagné ne sont pas à la hauteur d'un Pebble Beach ou d'un Augusta, mais gagner sur l'un des monuments du golf, c'est vraiment, vraiment cool", a déclaré McIlroy.
Alors qu'il débutait sa saison à Pebble Beach, il avait marqué les esprits dès le premier tour jeudi en réussissant un trou en un sensationnel au 15.
Le N°1 mondial américain Scottie Scheffler, de retour de blessure, a pris la 9ᵉ place finale ex æquo, à six coups de McIlroy.
Classement final :
1. Rory McIlroy (NIR) -21 (66-70-65-66)
2. Shane Lowry (IRL) -19 (66-70-65-68)
3. Lucas Glover (USA) -18 (66-69-68-67)
. Justin Rose (ENG) -18 (65-69-68-68)
5. Cameron Davis (AUS) -17 (65-68-69-69)
. Russell Henley (USA) -17 (64-69-71-67)
7. Kim Tom (KOR) -16 (69-65-68-70)
. Sepp Straka (AUT) -16 (65-65-70-72)
9. Billy Horschel (USA) -15 (72-65-70-66)
. Taylor Pendrith (CAN) -15 (67-70-69-67)
. Scottie Scheffler (USA) -15 (67-70-69-67)