Au guidon d'une Aprilia, Fernandez a dominé les qualifications avec un tour en 1 min 28 sec 852, sur la piste sèche et ensoleillée du circuit international de Mandalika.
Le pilote de 25 ans, de l'écurie Trackhouse, avait déjà réalisé le meilleur temps et établi un record du tour lors des essais libres vendredi.
Les Italiens Marco Bezzecchi (Aprilia Racing) et Fabio Di Giannantonio (Ducati VR46) le rejoindront en première ligne.
Les rivaux pour le titre, Marc Marquez (Ducati Lenovo) et Jorge Martin (Aprilia Racing), partiront côte à côte en deuxième ligne pour le sprint de samedi et la course principale dimanche.
Marquez, septuple champion du monde de la catégorie reine et tenant du titre, a signé le quatrième temps, à 266 millièmes de Fernandez.
Sacré en 2024, Martin (Aprilia), qui ne compte que deux points d'avance au classement du championnat sur son aîné, s’est qualifié en cinquième place.
Il accuse un retard de 300 millièmes sur Fernandez, alors qu'un autre Espagnol, Fermin Aldeguer (Ducati Gresini), a terminé sixième des qualifications.