Arrivé libre en juillet 2023 en provenance de l’Inter Milan, Škriniar n’a pas réussi à s’imposer à Paris sous les ordres de Luis Enrique (seulement cinq titularisations en Ligue 1 lors de la saison 2024‑2025). Il avait été prêté en janvier 2025 à Fenerbahçe, où il disputé 23 matches toutes compétitions confondues, inscrit 3 buts et délivré 1 passe décisive.
Sous la direction de José Mourinho, Škriniar a retrouvé du temps de jeu et de la confiance. Son agent avait alors indiqué qu’un retour au PSG n’était pas envisagé, le joueur se sentant pleinement intégré à Istanbul et apprécié du vestiaire turc. Il s'engage avec le Fener pour un contrat d'une durée de quatre saisons, contre 10 millions d'euros bonus inclus.